يحتوي قسم التربية الرياضية في جامعة الأقصى على برنامج أكاديمي (بكالوريوس) وآخر (ماجستير) متميزين يلبيان احتياجات سوق العمل الفلسطيني وهما:
- برنامج بكالوريوس التربية الرياضية.
- ماجستير التربية الرياضية.