تحتوي كلية التربية البدنية والرياضة في جامعة الأقصى على قسمين أكاديميين متميزين في التخصصات االرياضية النوعية والتي تتواءم مع احتياجات سوق العمل وهما:
- قسم التربية الرياضية.
- قسم التدريب الرياضي.
