تظهر جامعة الاقصى اهتماماً كبيراً في مجال المباني الصديقة للبيئة التي تراعي قضايا الاستدامة في الطاقة وتوفير المياه والحد من النفايات الصلبة وكفاءة التشغيل والصيانة ونوعية الإضاءة والتهوية والتدفئة في الأماكن المغلقة وتقليل التأثيرات البيئية، من خلال مراعاة تصميم الموقع وفق معايير المباني الخضراء وتحقيق الحد الأدنى من مستويات جودة الهواء الداخلي، والتركيز على استخدام تقنيات توفير المياه والطاقة.