أُنشئ قسم الأحياء عام 1991م والذي يعتبر واحداً من الأقسام الرئيسية في كلية العلوم، حيث يمنح الطلبة درجة البكالوريوس في الأحياء والأحياء وأساليب تدريسها بعد استيفائهم متطلبات التخرج ويقوم القسم بتأهيل الطلبة في مجال علوم الأحياء بفرعيه (علم الحيوان وعلم النبات). ولدى قسم الأحياء طاقم من الأكاديميين موزعين كالتالي (2) استاذ مشارك و (3) دكتوراه “أستاذ مساعد"، (5) ماجستير، ومعيد بالإضافة الى نخبة من الفنيين المؤهلين للإشراف على تجهيز وتشغيل المختبرات العلمية. يوجد ستة معامل لاستخدام الطلبة مجهزة بأحدث الأجهزة والتقنيات ثلاثة منها في فرع الجامعة بغزة وثلاثة في فرع خان يونس.
يعمل قسم الأحياء على التنمية المستمرة للمعرفة من خلال البحث العلمي الجاد الذي يقوم به أعضاء الهيئة التدريسية في القسم، كما يساهم في مد الهيئات الخدمية والإنتاجية والتنموية بالحلول العملية والاستشارات المتخصصة التي تعينهم على أداء مهامهم ودورهم في التنمية الشاملة، كما يهتم القسم أيضا بزيادة الوعي الصحي للمجتمع وحماية البيئة.