تأسس قسم علوم الحاسوب والمعلومات بجامعة الأقصى في عام 1995م؛ لمواكبة التطور التكنولوجي في عصر التكنولوجيا وثورة المعلومات؛ وذلك لإعداد كوادر متخصصة في مجال تكنولوجيا المعلومات والاتصالات، ودراسة وتصميم وتطوير وتنفيذ ودعم أنظمة المعلومات لحل التحديات الرئيسية في بيئة الأعمال اليومية. ويمنح القسم شهادة البكالوريوس في تخصص علم الحاسوب، وتكنولوجيا المعلومات التطبيقية.
يتميز قسم علوم الحاسوب والمعلومات بهيئة تدريسية حاصلة على شهادات علمية متنوعة من جامعات أجنبية وعربية مختلفة (أمريكا، بريطانيا، كندا، ألمانيا، ماليزيا، الهند، مصر، الأردن وغيرها) حيث يضم العديد من حملة شهادة الدكتوراه، والماجستير.
ولخدمة الطلبة توفر الجامعة مختبرات حاسوب مجهزة بأحدث المواصفات؛ ولتعميق الجانب التطبيقي يعمل القسم على عقد دورات تدريبية متخصصة، وإتاحة المجال للتدريب الميداني للطلبة في المؤسسات الحكومية والخاصة.
مجالات العمل التي يمكن لخريج قسم علوم الحاسوب والمعلومات الاندماج بها بسبب تعدد المسارات لهذا البرامج وهي هندسة البرمجيات، الذكاء الاصطناعي وعلم البيانات، تصميم وتطوير الويب، وتكنولوجيا الألعاب والوسائط، وحاجة سوق العمل لمتخصصين في هذه المجالات، ومنها: محلل و مصمم ومطور برمجيات، مدير مشاريع نظم المعلومات، مدير قواعد البيانات، مطور مواقع الويب، مطور تطبيقات الهواتف النقالة، تطوير وتصميم الوسائط المتعددة، أخصائي في العمل الحر عبر الانترنت في مجالات تكنولوجيا المعلومات، والعمل في هندسة الويب، وهندسة نظم المعلومات والبرمجيات، وصناعة الألعاب ومجال الذكاء الاصطناعي وعلم البيانات.