أنشئ قسم التاريخ في جامعة الأقصى في الفصل الأول من العام الجامعي 1995- 1996؛ تلبية لاحتياجات المجتمع الفلسطيني لكوادر بشرية متخصصة ومؤهلة في التاريخ، وحقل التدريس فيه.
وفي سياق رؤية القسم نحو التطور فهناك دراسة قيد البحث الآن تتعلق بإدخال عدد من مساقات العلاقات الدولية ضمن المساقات التي سيطرحها القسم.
ويمنح القسم درجة البكالوريوس في التخصصات الآتية :